Cerrar Mapa

Master Universitaire en

Amélioration génétique végétale

Édition actuelle : 1e partie : 26 septembre 2016 – 9 juin 2017 / 2e partie : septembre 2017 – juin 2018 ··
Prochaine édition : 1e partie : septembre 2018 – juin 2019 / 2e partie : septembre 2019 – juin 2020

Master Universitaire en

Amélioration génétique végétale

Description générale de l'unité

ECTS : 7
Heures de contact : 71 (57 cours, 14 travaux pratiques)
Heures de travail personnel : 104
Type : Obligatoire
Lieu de déroulement : Institut Agronomique Méditerranéen de Zaragoza, laboratoire du Département de Génétique et de Production Végétale de la Station Expérimentale de Aula Dei du CSIC.
Organisation temporelle
- Cette unité a lieu en première année académique du Master vers la fin du premier semestre et au début du deuxième.
- L'évaluation de l'unité est effectuée par un examen écrit et par notation des travaux realisés lors des sessions de discussion et des séances pratiques de laboratoire pendant le deuxième semestre.
Requis et permanence
Il n'y a pas de pré-requis
Méthodes d'enseignement
Combinaison de cours et travaux pratiques, étude et travail individuel et en groupe, et visites techniques.
Langue
Les professeurs délivrent les cours en espagnol ou en anglais. Dans ce dernier cas, la traduction simultanée est assurée vers l'espagnol. La documentation fournie par les professeurs est en espagnol ou en anglais.

 

Présentation de l'unité et contexte dans l'organisation des enseignements

Ici sont décrites et analysées les différentes méthodes pour l'obtention de lignées pures, de populations, d'hybrides, de variétés synthétiques et de clones, en évaluant leurs avantages et leurs limitations par rapport aux objectifs généraux et spécifiques du programme d'amélioration. L'amélioration assistée par marqueurs est actuellement introduite dans tous les programmes en tant qu'application directe de l'utilisation de marqueurs moléculaires pour sélectionner certains caractères ou génotypes par le biais du rétrocroisement assisté, de l'accumulation de gènes, de la sélection récurrente assistée par marqueurs, de la prédiction et la sélection génomiques et, en particulier, de la prédiction des hybrides. Finalement, l'unité aborde la production commerciale de semences et de plants comme fin ultime des programmes d'amélioration agricole, considérée depuis la commercialisation de nouvelles variétés jusqu'au marketing de semences, en analysant des questions cruciales telles que les droits de propriété, les procédures d'enregistrement, les processus de production et le contrôle de qualité des semences, ainsi que les aspects légaux de l'amélioration génétique végétale.

 

Compétences

Compétences spécifiques

  • CS7 Évaluer les différentes méthodes et techniques d'importance qui contribuent à une meilleure efficacité des processus de sélection et de mise au point de nouvelles variétés, en particulier les techniques moléculaires visant au développement de programmes de sélection assistée par marqueurs.
  • CS10 Planifier, développer et évaluer des programmes spécifiques d'amélioration génétique dans différentes situations et milieux, en tenant compte des matériels de départ, des objectifs fixés et des contraintes agronomiques, environnementales et socio-économiques.
  • CS11 Connaître la législation nationale et internationale concernant l'enregistrement de nouvelles variétés et la protection du droit à la propriété intellectuelle et, en particulier, les droits de l'obtenteur et les brevets.

Compétences générales

  • CG1 Intégrer les connaissances scientifiques et techniques et les appliquer de façon critique.
  • CG2 Effectuer des recherches d'informations scientifiques et/ou techniques et les soumettre à un traitement sélectif.
  • CG3 Analyser résultats ou stratégies et parvenir à des conclusions permettant de clarifier les problèmes afin d'y trouver une solution.
  • CG7 Communiquer les raisonnements et les conclusions autant à un auditoire général qu'à un public spécialisé.

 

Résultats d'apprentissage

À l'issue de l'apprentissage de l'unité, l'étudiant :

  • Connaît les types de variétés qui sont cultivées commercialement et les caractéristiques de chacune d’elles
  • Connaît les particularités des processus d’amélioration et d’obtention de nouvelles lignées pures, populations, hybrides et clones
  • Analyse les facteurs qui déterminent la stratégie de sélection à appliquer dans un programme donné
  • A approfondi l’application des marqueurs moléculaires pour la sélection assistée en tant qu’outil permettant de faciliter les processus d’obtention de nouvelles variétés
  • Maîtrise les différentes méthodes de sélection, y compris les méthodes assistées par marqueurs, et a acquis des critères permettant de déterminer lesquelles sont les plus appropriées en fonction de l’objectif d’amélioration, le type de reproduction de la culture, les caractères à améliorer et les conditions environnementales
  • Est familiarisé avec les processus d’obtention de semences et de plants certifiés, avec le traitement des semences et avec le fonctionnement du secteur du marketing des semences, comme partie finale du processus d’amélioration génétique
  • Connaît la législation nationale et internationale concernant l’enregistrement de nouvelles variétés et la protection du droit à la propriété intellectuelle et, en particulier, des droits de l’obtenteur

 

Contenu

  • Méthodes d'amélioration
  • Lignées pures
  • Populations
  • Hybrides
  • Variétés synthétiques
  • Clones
  • Sélection assistée par marqueurs
  • Rétrocroisement assisté
  • Accumulation de gènes (Gene pyramiding)
  • Sélection récurrente assistée
  • Prédiction génomique et sélection
  • Prédiction d'hybrides
  • Production commerciale de semences et de plants
  • Aspects légaux de l'amélioration végétale

Activités d'apprentissage

Activité d'apprentissage 1 : Cours magistraux combinés à des études de cas, en particulier concernant la présentation de programmes d'amélioration végétale
ECTS : 5,4
Heures : 135
Pourcentage en contact : 42%

Activité d'apprentissage 2 : Sessions de discussion conjointe de publications singulières et d'exemples concrets de programmes d'amélioration. Des groupes de 4-5 étudiants seront constitués et se répartiront le travail. Chaque groupe reçoit une documentation sur des programmes d'amélioration et devra présenter en public ses publications et/ou programmes d'amélioration et animer la discussion générale. Finalement le groupe préparera un document de synthèse sur la documentation reçue et la discussion générale.
ECTS : 0,6
Heures : 15
Pourcentage en contact :  13,5%

Activité d'apprentissage 3 : Travaux pratiques de laboratoire pour déterminer l'empreinte de sélection dans un programme d'amélioration chez une espèce autogame. Ces travaux auront lieu au laboratoire du Département de Génétique et de Production Végétale de la Station Expérimentale de Aula Dei du CSIC. Les étudiants travaillent en groupes de deux et analysent les résultats obtenus dans le laboratoire à l'aide d'un logiciel et élaborent un rapport avec les résultats et conclusions.
ECTS : 0,5
Heures : 12
Pourcentage en contact : 33%

Activité d'apprentissage 4 : Séminaire-table ronde sur le rôle des variétés transgéniques dans différents systèmes agricoles en insistant autant sur les aspects techniques que socio-économiques et en particulier sur ceux qui concernent les IP et FTO (intellectual property et freedom to operate). Il sera remis aux étudiants une documentation pour et contre afin de favoriser leur participation.
ECTS : 0,2
Heures : 5
Pourcentage en contact : 40%

Activité d'apprentissage 5 : Visite technique d'une entreprise d'amélioration végétale, telle que Limagrain-Ibérica à Pamplona.
ECTS : 0,3
Heures : 8
Pourcentage en contact : 75%

 

Méthodes d'évaluation

Système d'évaluation 1 : Examen écrit, composé à partir de questions préparées par les différents professeurs de l'unité. Il s'agit de questions concrètes et rédactionnelles brèves. L'examen évalue autant le contenu des conférences que la compréhension de la discussion du séminaire-table ronde et des processus observés lors de la visite technique.
Pour l'examen écrit les questions sont notées d'après la précision conceptuelle et technique de la réponse et la démarche du raisonnement.
Pondération : 65% de la note finale de l'unité

Système d'évaluation 2 : Évaluation globale par les professeurs de :
a) La participation active aux sessions de discussion conjointe de publications. La note finale est basée autant sur le document écrit que sur la participation à la discussion. La note est la même pour tous les membres du groupe
b) Les séances pratiques de laboratoire. La note est basée sur la validité des résultats obtenus et la qualité du rapport. La note est la même pour les deux membres du groupe.
Pondération : 35% de la note finale de l'unité

 

Professeurs

Javier BETRÁN, Monsanto, Toulouse (France)
Ana CASAS, CSIC-EEAD, Zaragoza (Espagne)
Paul CHRISTOU, UdL-ICREA, Lleida (Espagne)
Jaime COSTA, Monsanto Agricultura España S.L., Madrid (Espagne)
José ELENA, Consultor-CPVO, Madrid (Espagne)
Ana GARCÉS, CITA-GA, Zaragoza (Espagne)
Yolanda GOGORCENA, CSIC-EEAD, Zaragoza (Espagne)
Ernesto IGARTUA, CSIC-EEAD, Zaragoza (Espagne)
Ian MACKAY, NIAB, Cambridge (Royaume-Uni)
José Miguel MARTÍNEZ ZAPATER, ICVV, Logroño (Espagne)
M. Ángeles MORENO, CSIC-EEAD, Zaragoza (Espagne)
Jesús MORENO, CIAM, La Coruña (Espagne)
Enrique SÁNCHEZ-MONGE, Limagrain, Pamplona (Espagne)
José Miguel VILLAÚ, DuPont Pioneer Spain, Sevilla (Espagne)